Trường Bế Văn Đàn được thành lập vào tháng 9 năm 1964 tại địa chỉ số 2 ngõ 14 Hồ Đắc Di – quận Đống Đa – Thành phố Hà Nội. Ngôi trường vinh dự mang tên người anh hùng liệt sĩ Bế Văn Đàn đã lấy thân mình làm giá súng, anh dũng hi sinh trong cuộc kháng chiến chống thực dân Pháp.
Khi mới thành lập, trường trực thuộc Tổng cục Chính trị Quân đội nhân dân Việt Nam. Từ tháng 2 năm 1969, trường được sáp nhập vào hệ thống giáo dục quận Đống Đa với tên gọi là Trường cấp 1,2 Bế Văn Đàn. Từ năm học 1993 - 1994, trường được tách thành hai cấp với tên gọi là trường TH Bế Văn Đàn và trường THCS Bế Văn Đàn.
Từ cái nôi là trường chuyên của Quận với hai bộ môn Toán và Ngoại ngữ, đã có hàng ngàn học sinh giỏi các cấp trưởng thành và phát triển dưới mái trường THCS Bế Văn Đàn
Cùng với sự phát triển, đổi mới, đi lên của đất nước, ngôi trường THCS Bế Văn Đàn đã nhận được sự quan tâm, đầu tư xây dựng của Quận và Thành phố. Vào năm 2012, nhà trường được chuyển sang địa điểm mới khang trang, hiện đại tại ngõ 181 Nguyễn Lương Bằng – quận Đống Đa – Hà Nội.
Trong hành trình của sự nghiệp giáo dục, trường THCS Bế Văn Đàn đã ghi danh vào bảng vàng với nhiều danh hiệu cao quý:
- Năm học 1990 – 1991 và năm học 2019 - 2020, trường vinh dự được nhà nước tặng thưởng Huân chương Lao động Hạng Ba.
- Năm 1992, trường được tổ chức Quốc tế UNESCO kết nạp là thành viên liên kết các trường học Quốc tế.
- Năm học 1995 - 1996, trường được nhà nước tặng thưởng Huân chương Lao động Hạng Nhì. Đây là một phần thưởng cao quý cho sự nỗ lực vượt bậc của đội ngũ cán bộ, giáo viên, nhân viên và các thế hệ học sinh.
- Từ năm học 2005 - 2006 đến nay, trường liên tục được công nhận là “Tập thể Lao động xuất sắc” cấp Thành phố.
- Nhà trường được Bộ Giáo dục và Đào tạo tặng Bằng khen năm 2010 – 2011 và năm 2016 - 2017
- Năm học 2011- 2012, vô cùng tự hào khi trường được Thủ tướng Chính phủ tặng Bằng khen “Đơn vị có thành tích trong công tác Giáo dục và Đào tạo”.
- Năm học 2017 – 2018 và năm học 2021 – 2022, trường được UBND thành phố Hà Nội tặng bằng khen “Đơn vị đã hoàn thành xuất sắc nhiệm vụ công tác năm học”.
- Năm học 2018 – 2019 và năm học 2023 – 2024, trường được tặng Cờ thi đua đơn vị xuất sắc nhất trong phong trào thi đua của UBND TP Hà Nội.
- Nhiều năm liền, liên đội nhà trường được tặng Cờ thi đua đơn vị xuất sắc nhất trong công tác Đội và phong trào thiếu nhi của Trung ương Đoàn TNCS Hồ Chí Minh và Thành Đoàn Hà Nội.
- Từ tháng 12/2013 trường đạt Chuẩn Quốc gia và tháng 01/2020 trường được các cấp có thẩm quyền công nhận lại với chất lượng giáo dục ngày càng nâng cao.
Để có được những thành tích đáng trân trọng trên là nhờ vào sự chỉ đạo của các cấp chính quyền, sự lãnh đạo của các thế hệ cán bộ quản lý, sự cống hiến của tập thể giáo viên cùng với nỗ lực học tập, rèn luyện của tất cả các thế hệ học sinh nhà trường.
Trải qua quá trình xây dựng và trưởng thành, trường THCS Bế Văn Đàn đã phát triển lớn mạnh không ngừng. Cơ sở vật chất tiện nghi, hiện đại. Đội ngũ cán bộ, giáo viên, nhân viên đạt trình độ chuẩn và trên chuẩn, sáng tạo, trách nhiệm và tâm huyết; số lượng học sinh theo học tại trường không ngừng tăng lên. Những năm qua, trường luôn là cái nôi nuôi dưỡng và giáo dục nhiều thế hệ học sinh, xứng đáng là điểm sáng của ngành Giáo dục - Đào tạo quận Đống Đa. Lớp lớp các thế hệ cán bộ, giáo viên, nhân viên và học sinh nhà trường vô cùng tự hào khi nhắc tới mái trường THCS Bế Văn Đàn thân yêu.
Đặc biệt, trong nhiều năm gần đây, chất lượng giáo dục của trường THCS Bế Văn Đàn đã có những bứt phá, vươn lên mạnh mẽ, là một trong số những đơn vị dẫn đầu trong phong trào giáo viên giỏi – học sinh giỏi của Quận, Thành phố và Quốc gia.
Năm học 2023 – 2024, được sự quan tâm của các cấp lãnh đạo, trường THCS Bế Văn Đàn đã cải tạo, sửa chữa và xây mới hai bên hành lang dãy nhà B, thêm 8 phòng học bộ môn đáp ứng chương trình giáo dục phổ thông 2018 và trường Chuẩn Quốc gia.
Trường THCS Bế Văn Đàn ngày nay có nhiều đổi thay về mọi mặt. Với tầm nhìn và sứ mạng: “Sáng tạo, sẻ chia, trách nhiệm, yêu thương” THCS Bế Văn Đàn sẽ mãi là điểm đến của niềm tin, khát vọng học tập và giáo dục; là trường học hạnh phúc, nơi khơi dậy, nuôi dưỡng những ước mơ và lan tỏa những giá trị nhân văn cao đẹp.